Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem185aA2AF53 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem185aA2AF53 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms