Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
1700023F06RikA2AB62 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700023F06RikA2AB62 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms