Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprfA2A8L5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms