Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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