Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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