Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv23A0A0A6YWQ1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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