Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W1

Ighv1-50, Immunoglobulin heavy variable 1-50 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-50A0A075B5W1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ighv1-50A0A075B5W1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-50A0A075B5W1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-50A0A075B5W1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-50A0A075B5W1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-50A0A075B5W1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-50A0A075B5W1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-50A0A075B5W1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-50A0A075B5W1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Ighv1-50A0A075B5W1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-50A0A075B5W1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-50A0A075B5W1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-50A0A075B5W1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Ighv1-50A0A075B5W1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ighv1-50A0A075B5W1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ighv1-50A0A075B5W1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ighv1-50A0A075B5W1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ighv1-50A0A075B5W1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ighv1-50A0A075B5W1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ighv1-50A0A075B5W1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ighv1-50A0A075B5W1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ighv1-50A0A075B5W1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ighv1-50A0A075B5W1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ighv1-50A0A075B5W1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ighv1-50A0A075B5W1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ighv1-50A0A075B5W1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ighv1-50A0A075B5W1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ighv1-50A0A075B5W1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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