Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Col5a3Q9JLI2 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Col5a3Q9JLI2 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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Col5a3Q9JLI2 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Col5a3Q9JLI2 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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