Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Csmd1Q923L3 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms