Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hoxa13Q62424 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Hoxa13Q62424 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxa13Q62424 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxa13Q62424 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxa13Q62424 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxa13Q62424 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxa13Q62424 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxa13Q62424 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Hoxa13Q62424 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxa13Q62424 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms