Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Grhl3-201ENSMUST00000105855 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Scg2-202ENSMUST00000185234 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gtpbp6Q3U6U5 Igsf1-202ENSMUST00000072037 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrl3-209ENSMUST00000119385 4905 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ypel5-201ENSMUST00000045174 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Lima1-202ENSMUST00000109024 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Scnn1a-203ENSMUST00000176110 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Tkt-201ENSMUST00000022529 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ncor1-202ENSMUST00000037575 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Melk-201ENSMUST00000045607 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Apex2-204ENSMUST00000112721 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Cd22-203ENSMUST00000186154 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Dgkg-202ENSMUST00000089925 3555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms