Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Ctdnep1Q3TP92 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ctdnep1Q3TP92 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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