Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Samd11Q1RNF8 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Samd11Q1RNF8 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Samd11Q1RNF8 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Samd11Q1RNF8 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Samd11Q1RNF8 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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Samd11Q1RNF8 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Samd11Q1RNF8 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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Samd11Q1RNF8 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Samd11Q1RNF8 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Samd11Q1RNF8 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Samd11Q1RNF8 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Samd11Q1RNF8 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Samd11Q1RNF8 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Samd11Q1RNF8 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms