Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PtprmP28828 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PtprmP28828 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PtprmP28828 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PtprmP28828 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
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