Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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H2-Q1O19441 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
H2-Q1O19441 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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