Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Clrn2B2RVW2 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Clrn2B2RVW2 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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