Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Spocd1B1ASB6 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Spocd1B1ASB6 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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Spocd1B1ASB6 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Spocd1B1ASB6 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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