Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Col5a3Q9JLI2 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms