Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Usp35M0QWN7 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp35M0QWN7 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp35M0QWN7 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp35M0QWN7 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp35M0QWN7 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Usp35M0QWN7 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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Usp35M0QWN7 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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Usp35M0QWN7 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Usp35M0QWN7 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124 ms