Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm45345-201ENSMUST00000211427 555 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Snx8Q8CFD4 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms