Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NischQ80TM9 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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