Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms