Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Atg9aQ68FE2 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Atg9aQ68FE2 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms