Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
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Rpusd2Q149F1 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
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Rpusd2Q149F1 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
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Rpusd2Q149F1 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
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Rpusd2Q149F1 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
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Rpusd2Q149F1 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
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Rpusd2Q149F1 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
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Rpusd2Q149F1 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
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