Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Tdpx-ps1-201ENSMUST00000117372 597 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Sh3bp1P55194 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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