Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Tifab-201ENSMUST00000169652 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Nsun3-201ENSMUST00000063089 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Wdr59-203ENSMUST00000211981 3618 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Arpp19-209ENSMUST00000169492 3963 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ift122-202ENSMUST00000112923 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm37949-201ENSMUST00000192808 2091 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Tmem63c-202ENSMUST00000131878 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Tvp23a-201ENSMUST00000051118 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm42515-201ENSMUST00000199936 3583 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 4930470B04Rik-201ENSMUST00000192005 1926 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ptbp3-210ENSMUST00000173699 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Serpina3f-201ENSMUST00000101080 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Rhpn2-202ENSMUST00000085556 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Lrrc1-201ENSMUST00000113421 2630 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Zfp819-201ENSMUST00000032661 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Prpf40a-208ENSMUST00000210789 3773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.9 ms