Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Nop56Q9D6Z1 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Nop56Q9D6Z1 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Nop56Q9D6Z1 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Nop56Q9D6Z1 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Nop56Q9D6Z1 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Nop56Q9D6Z1 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Nop56Q9D6Z1 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Nop56Q9D6Z1 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Nop56Q9D6Z1 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Nop56Q9D6Z1 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Nop56Q9D6Z1 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Nop56Q9D6Z1 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Smco3-202ENSMUST00000111894 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm12464-201ENSMUST00000121385 1016 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Nop56Q9D6Z1 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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