Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Gjb1P28230 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb1P28230 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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