Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb4A2A863 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb4A2A863 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb4A2A863 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb4A2A863 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb4A2A863 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb4A2A863 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb4A2A863 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb4A2A863 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb4A2A863 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Itgb4A2A863 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Ccdc180-204ENSMUST00000178561 5081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Vps39-202ENSMUST00000102501 4384 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Itgb4A2A863 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms