Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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OtofQ9ESF1 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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OtofQ9ESF1 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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OtofQ9ESF1 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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OtofQ9ESF1 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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OtofQ9ESF1 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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OtofQ9ESF1 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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OtofQ9ESF1 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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OtofQ9ESF1 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
OtofQ9ESF1 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OtofQ9ESF1 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
OtofQ9ESF1 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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