Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Trim12aQ99PQ1 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Trim12aQ99PQ1 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Trim12aQ99PQ1 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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