Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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