Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RxraP28700 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RxraP28700 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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