Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm46364-201ENSMUST00000218548 319 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Pde6aP27664 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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