Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Zfp78-202ENSMUST00000108559 1539 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Vpreb1P13372 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181 ms