Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Ubn2-205ENSMUST00000160583 14644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm20388-201ENSMUST00000127664 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Rpusd2Q149F1 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms