Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hoxc13P50207 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms