Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PtprmP28828 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
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PtprmP28828 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PtprmP28828 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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PtprmP28828 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PtprmP28828 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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