Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Gjb1P28230 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms