Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Ccl20O89093 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Ccl20O89093 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms