Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
ChmQ9QXG2 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ChmQ9QXG2 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms