Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Usp1Q8BJQ2 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms