Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Olfr978-202ENSMUST00000217600 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm29681-201ENSMUST00000198696 4233 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Rdh12-201ENSMUST00000021548 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Wdr11-201ENSMUST00000084519 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
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Rpusd2Q149F1 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Rpusd2Q149F1 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
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