Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ttc21bQ0HA38 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ttc21bQ0HA38 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ttc21bQ0HA38 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ttc21bQ0HA38 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ttc21bQ0HA38 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ttc21bQ0HA38 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ttc21bQ0HA38 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ttc21bQ0HA38 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Ttc21bQ0HA38 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms