Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd13P70217 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd13P70217 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd13P70217 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Hoxd13P70217 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd13P70217 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd13P70217 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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Hoxd13P70217 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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Hoxd13P70217 Gm11940-201ENSMUST00000153599 417 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Hoxd13P70217 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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