Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm9267-201ENSMUST00000222831 404 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rps29P62274 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rps29P62274 Olfr115-202ENSMUST00000221552 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms