Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
PtprkP35822 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PtprkP35822 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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