Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ggta1P23336 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ggta1P23336 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms