Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Pramef12Q9D2F1 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Pramef12Q9D2F1 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Pramef12Q9D2F1 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Pramef12Q9D2F1 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Pramef12Q9D2F1 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Pramef12Q9D2F1 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Pramef12Q9D2F1 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Pramef12Q9D2F1 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Pramef12Q9D2F1 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Pramef12Q9D2F1 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Pramef12Q9D2F1 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Pramef12Q9D2F1 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Pramef12Q9D2F1 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Pramef12Q9D2F1 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Pramef12Q9D2F1 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Pramef12Q9D2F1 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Pramef12Q9D2F1 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Pramef12Q9D2F1 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Pramef12Q9D2F1 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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Pramef12Q9D2F1 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Pramef12Q9D2F1 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms