Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc18Q640L5 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms